分子生物学实验

CUT&Tag技术 RNA结合蛋白免疫沉淀（RIP） ChIRP GST pull-down实验 DNA pull-down实验 RNA pull-down实验 ChIP-Seq 凝胶迁移实验染色质免疫共沉淀技术免疫共沉淀检测外泌体分离与检测 ELISA检测 Western Blot 原位杂交双荧光素酶检测

CUT&Tag技术

CUT&Tag技术

CUT&Tag (Cleavage Under Targets and Tagmentation)，即靶向剪切及转座酶技术，通过能够与抗体结合的Tn5转座酶靶向目标蛋白，对蛋白结合位点附近DNA进行切割与标记，然后利用Tn5接头序列进行后续建库测序。该技术是一种利用酶锚定技术进行高效、高分辨率的DNA测序文库构建方法，适用于蛋白质-DNA互作研究。

CUT & Tag原理

CUT & Tag是新一代超微量ChIP-Seq技术。与传统的ChIP-Seq研究方法相比，该技术可用于无ChIP级别抗体的蛋白研究，无需交联、超声打断、末端抹平和接头连接等繁琐的操作，因此具有省时高效、所需的样品量少、背景信号低、可重复性好等优点，甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag技术革命性地颠覆了以往繁琐复杂的蛋白质-DNA互作研究技术，有望将蛋白质-DNA互作的研究变成一种类似PCR反应的常规操作，对基因调控、表观遗传等领域的研究具有革命性的意义。

技术优势

	ChIP-seq	CUT & Tag
操作	繁琐	简便
细胞量要求	10^6以上	低至60个细胞
打断方式	超声，MNase	Tn5
建库周期	3天	1天
数据信噪比	低	高
测序数据量	多	少
数据重复性	低	高

分析内容

结果展示

CUT&Tag技术与传统ChIP-seq技术相比，结合信号更强(K4me1,图A)，背景更低(K27me3,图B)，不需要input control，有效reads占比高，能利用更少的reads识别蛋白结合位点信息(图C)，样本间重复性更好(图D）。

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