分子生物学实验
CUT&Tag技术 RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP) ChIRP GST pull-down实验 DNA pull-down实验 RNA pull-down实验 ChIP-Seq 凝胶迁移实验 染色质免疫共沉淀技术 免疫共沉淀检测 外泌体分离与检测 ELISA检测 Western Blot 原位杂交 双荧光素酶检测ChIRP
ChRIP-RNA
探针设计与合成→细胞交联→细胞裂解/超声处理→探针杂交→复合物纯化→RNA回收与纯化→RNA-seq或qRT-PCR检测;
ChRIP-DNA
探针设计与合成→细胞交联→细胞裂解/超声处理→探针杂交→复合物纯化→DNA回收与纯化→NGS或qPCR检测;
ChRIP-Protein
探针设计与合成→细胞交联→细胞裂解/超声处理→探针杂交→复合物纯化→蛋白分离→MS鉴定。
可以研究细胞体内互作;
可以同时研究RNA、蛋白质和DNA形成的复合体之间的互作,也可研究它们之间的两两互作;
利用ChRIP-MS实验寻找与目的lncRNA结合的蛋白,可不受lncRNA长度的限制。