分子生物学实验
CUT&Tag技术 RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP) ChIRP GST pull-down实验 DNA pull-down实验 RNA pull-down实验 ChIP-Seq 凝胶迁移实验 染色质免疫共沉淀技术 免疫共沉淀检测 外泌体分离与检测 ELISA检测 Western Blot 原位杂交 双荧光素酶检测DNA pull-down实验
DNA pull-down是体外研究DNA与蛋白互作的有力工具。该技术将生物素标记的DNA片段结合在链霉亲和素磁珠上,再与细胞核蛋白孵育,纯化出与DNA片段互作的蛋白,洗涤洗脱得到的蛋白产物,做Western-blot检测特定蛋白是否与靶DNA片段结合;做质谱鉴定即可筛选出与DNA片段可能互作的蛋白信息(如:转录因子、组蛋白等)。
生物素与链霉亲和素间的作用是目前已知强度最高的非共价作用;其中活化生物素可以在蛋白质交联剂的介导下,与已知的几乎所有生物大分子偶联。因此用生物素标记核酸后,可以纯化出与该核酸结合的各种生物大分子复合物。


探针设计及标记:针对靶标区域设计特异性DNA探针,探针经过脱硫生物素标记,跟偶联在磁珠上的链霉亲和素结合;
pull-down:细胞核提取物与磁珠-DNA探针孵育,靶DNA可以和DNA探针特异性结合,纯化出与靶DNA片段结合的蛋白复合体,经过洗涤可以将非特异性结合蛋白质去除;最后,洗脱得到与靶DNA结合的蛋白质复合物;
互作蛋白质鉴定:再经过Western Blot或质谱(MS)鉴定蛋白质。
DNA探针的设计与合成;
细胞培养与核蛋白提取;
pull-down捕获互作蛋白;
Western blot验证;
MS鉴定可能的互作蛋白。
提供完整的实验报告;
客观公正的原始数据和实验结果分析。